Так как игра эпизодическая, то и сюжет будет указываться по эпизодам. Принцип построения сюжета: прошлое, настоящее, примерное будущее (последний может меняться). Также разделен по месту происходящего.
! Разделение по месту вовсе не влияет на время происходящего. Эпизоды в Генсее могут происходить раньше, позже или одновременно с происходящим в Сейретее или Уэко Мундо.

Законченные эпизоды (прошлое).

Генсей:
- Матсумото Рангику из-за каких-то катаклизмов попадает в Генсей и сталкивается сразу с Ичиго, Коном и неизвестной никому девушкой, которая на удивление может ее слышать. Решив воспользоваться внеплановым отдыхом, лейтенант 10 отряда убегает делать покупки.
- Саругаки Хиори, решив проверить необычную реяцу, посылает сопротивляющегося Синдзи "найти и привести" Ичиго. Но не выдержав ожидания, сама отправляется увидеть его.
- Хирако Синдзи заявляется в школу Ичиго и Ко в качестве нового ученика, успевает "влюбиться" в Орихиме и даже тонко намекнуть Ичиго, что желает с ним поговорить наедине. После чего бесследно исчезает из класса.

Сейретей:
- Матсумото Рангику уже который день топит горе в сакэ. И вот однажды утром она просыпается в административном кабинете своего отряда с жутким похмельем, где ее и обнаруживает Хитсугойя Тоширо. Решив отучить свою нерадивую подчиненную столько пить, он заставляет ее убираться. К ее счастью приходит офицер с сообщением о ее новом задании.
- Хинамори Момо лежит в больнице и переживает не лучшие времена в своей жизни. Как верный друг, Кира Изуру приходи ее навестить. Но тут его и находят с извещением о новом задании.
- Оказывается, что Рангику и Кире дали совместное задание - проверить проход между мирами. Они начали успешно его выполнять, как случилось что-то непонятное и Рангику унесло в Генсей.

Уэко Мундо:
- Улькиорра и Гриммдожоу столкнулись в коридорах Лас Ночеса и, услышав голос 9го, поспешили в главный зал.

Текущие эпизоды (настоящее).
Генсей:
- Хирако Синдзи и Куросаки Ичиго встретились в назначенном вайзардом месте, но тут внезапно появляется Хиори. К чему приведет разговор этих троих?
- Исида Урюю и Иноуэ Орихимэ возвращаются домой после школы, но случайная встреча с Рангику задерживает их в городе еще на неопределенный срок. Что они будут делать и чем это обернется?

Сейретей:
- Кучики Бьякуя и Абараи Ренджи как всегда работали (и не только). Но как только с делами было покончено и Ренджи уже составил себе планы на вечер, ему дали срочное задание - найти Матсумото Рангику.

Уэко Мундо:

Предполагаемое развитие сюжета.
Генсей:

Сейретей:

Уэко Мундо: - Айзен принимает решение о первом посещении Эспадой Генсея.